More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1208 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 384 aa  779    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  62.76 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  59.33 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.42 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  59.33 
 
 		 391 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  62.83 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  59.59 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  62.37 
 
 		 381 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  60.1 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  60.1 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  59.32 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  59.74 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  60.68 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  56.28 
 
 		 393 aa  431  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  57.74 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  58.85 
 
 		 397 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  57.22 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  56.43 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  55.06 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  57.45 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  57.45 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  56.08 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  52.23 
 
 		 386 aa  378  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.19 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  53.79 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  54.81 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 409 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.77 
 
 		 413 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  50.66 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  49.47 
 
 		 397 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  48.66 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  47.62 
 
 		 383 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  47.33 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  48.94 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  46.88 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  47.18 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  48.67 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.48 
 
 		 408 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  42.82 
 
 		 387 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  47.47 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.53 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.91 
 
 		 395 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  42.82 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  45.24 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  42.55 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  45.16 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  44.97 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  42.29 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  42.29 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  43.62 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  44.3 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  43.95 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  40.9 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  43.39 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 383 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  46.13 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 385 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 390 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.18 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  43.24 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  45.01 
 
 		 391 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.11 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  42.93 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  43.28 
 
 		 417 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  39.31 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  39.31 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  39.31 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  41.36 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  39.31 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  39.31 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  39.31 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  37.25 
 
 		 413 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  41.91 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  40.42 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  40.68 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  40.79 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  40.94 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  41.05 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  38.52 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  39.07 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  42.34 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  39.26 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  40.53 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  39.74 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  38.79 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>