More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4321 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  816    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  78.59 
 
 		 383 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  77.84 
 
 		 384 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  73.52 
 
 		 394 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  73.01 
 
 		 394 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  72.49 
 
 		 394 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  63.03 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  66.67 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  62.86 
 
 		 384 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  63.03 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  61.8 
 
 		 384 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  65.27 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  61.64 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  64.72 
 
 		 384 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  64.72 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  61.54 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  54.55 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  53.56 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  53.68 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  55.67 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  54.12 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  48.28 
 
 		 391 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  49.6 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  48.41 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  48.4 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  47.7 
 
 		 395 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.27 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  46.79 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  48.52 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  47.07 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  45.99 
 
 		 385 aa  316  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.32 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.7 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  47.84 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  45.09 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  47.66 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  41.89 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  46.13 
 
 		 409 aa  307  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  45.01 
 
 		 385 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  45.18 
 
 		 400 aa  305  9.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  47.98 
 
 		 397 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  43.28 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  47.87 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  43.28 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  43.24 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  44.2 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  43.28 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  43.78 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  45.09 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  43.28 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  45.01 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  43.28 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  43.28 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  43.28 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  43.78 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  44.5 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 386 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  43.65 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.72 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.26 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.74 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  46.56 
 
 		 381 aa  299  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  43.85 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  45.04 
 
 		 389 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  45.09 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  45.09 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.82 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  44.24 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.73 
 
 		 402 aa  292  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.9 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  43.13 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  41.49 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 389 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  42.74 
 
 		 386 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.67 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3295  putative aminotransferase  42.86 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  45.85 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  42.2 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 379 aa  285  9e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  44 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 		 401 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  43.63 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  41.88 
 
 		 389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  45.14 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  39.45 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  40.61 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.62 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.22 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>