More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2218 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 382 aa  771    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  79 
 
 		 394 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  75.99 
 
 		 387 aa  567  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  70.08 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  66.93 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.05 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  62.8 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  65.36 
 
 		 397 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  64.3 
 
 		 381 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  64.58 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  57.74 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  64.04 
 
 		 387 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.84 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  57.92 
 
 		 413 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  54.29 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  56.2 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  54.29 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  58.76 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  56.17 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.68 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  56.58 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  54.99 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  52.86 
 
 		 391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  54.29 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  57.41 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  54.29 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  54.88 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.35 
 
 		 402 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.36 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  54.79 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  52.89 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  52.41 
 
 		 383 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  53.87 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  49.87 
 
 		 384 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  47.86 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  52.01 
 
 		 388 aa  345  8e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  48.12 
 
 		 385 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  47.85 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  46.93 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  49.47 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.44 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  50.8 
 
 		 383 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  49.46 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  49.07 
 
 		 383 aa  332  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  50.4 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.49 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.33 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  48.39 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  47.48 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  47.87 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  47.87 
 
 		 394 aa  316  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.42 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  44.36 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  39.58 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  43.83 
 
 		 384 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  44.16 
 
 		 389 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.42 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  42.15 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.04 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.37 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  45.67 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  41.99 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  42.37 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  42.04 
 
 		 385 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  41.47 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.34 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.32 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 385 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 382 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 382 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  42.37 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.84 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.11 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  41.98 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>