More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4149 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  91.03 
 
 		 383 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  773    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  77.84 
 
 		 409 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  76.19 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  76.72 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  74.74 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  68.41 
 
 		 384 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  74.6 
 
 		 398 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  66.93 
 
 		 384 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  67.72 
 
 		 384 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  67.8 
 
 		 387 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  67.64 
 
 		 385 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  70.37 
 
 		 384 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  70.83 
 
 		 383 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  69.31 
 
 		 383 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  62.7 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  57.52 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  54.17 
 
 		 392 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  56.15 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  56.88 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  54.35 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  53.87 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  50.53 
 
 		 386 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  49.34 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  52.29 
 
 		 389 aa  348  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  49.87 
 
 		 391 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  50.53 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  51.18 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  49.07 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  48.95 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 		 393 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  51.86 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  47.09 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  51.99 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  48.93 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  47.07 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  49.6 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  46.7 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.83 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  46.79 
 
 		 395 aa  319  7e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  45.53 
 
 		 391 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.03 
 
 		 385 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  47.45 
 
 		 387 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.93 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  48.4 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  47.73 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  45.84 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  47.45 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  46.84 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  46.84 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  42.63 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  42.36 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  42.09 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 		 381 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  45.58 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  42.36 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  42.36 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  46.65 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  43.7 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  42.09 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  44.65 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  43.35 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  44.3 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  44.41 
 
 		 383 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  43.55 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  43.78 
 
 		 390 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 384 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 391 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  45.17 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 391 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  44.86 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  44.15 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  44.59 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  44.47 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  44.24 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  47.15 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  44.92 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  44.92 
 
 		 390 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  43.51 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  44.65 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  43.16 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  42.7 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  45.24 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  44.91 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  42.9 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.86 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  42.9 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.53 
 
 		 413 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>