More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2445 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  90.03 
 
 		 394 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  795    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  90.54 
 
 		 394 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  76.7 
 
 		 383 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  74.74 
 
 		 384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  72.49 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  64.99 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  63.68 
 
 		 387 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  68.87 
 
 		 398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  64.8 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  64.8 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  64.29 
 
 		 385 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  66.23 
 
 		 383 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  65.25 
 
 		 384 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  64.99 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  60.48 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  58.79 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  53.54 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  55.65 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  54.38 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  53.58 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  50.68 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  48.81 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  50.8 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  51.62 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  48.92 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  47.75 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.03 
 
 		 386 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  46.47 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.73 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  49.6 
 
 		 387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  48.39 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  46.67 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  49.21 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  47.09 
 
 		 381 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  44.44 
 
 		 386 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  44.44 
 
 		 386 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.28 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 386 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  43.19 
 
 		 386 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  43.19 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.05 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  47.07 
 
 		 401 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 386 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  45.97 
 
 		 409 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  48.39 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  43.9 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  42.93 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  44.35 
 
 		 385 aa  302  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  46.01 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.77 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  44.09 
 
 		 385 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  45.7 
 
 		 387 aa  298  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.68 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  44.44 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 385 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  43.82 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.9 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  40.86 
 
 		 413 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  43.01 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.55 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  43.38 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.82 
 
 		 383 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 389 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  40.56 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  42.08 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  46.13 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.9 
 
 		 390 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.55 
 
 		 383 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.54 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  42.28 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  44.06 
 
 		 391 aa  288  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.92 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  43.97 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  41.58 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.35 
 
 		 402 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  42.22 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.41 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.52 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  42.16 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1373  putative aminotransferase  42.09 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  41.95 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>