More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4557 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  811    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  73.54 
 
 		 383 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  74.6 
 
 		 384 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  66.49 
 
 		 387 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  66.93 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  66.14 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  66.05 
 
 		 385 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  65.34 
 
 		 384 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  69.23 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  67.2 
 
 		 383 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  68.89 
 
 		 394 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  68.12 
 
 		 394 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  65.8 
 
 		 384 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  65.96 
 
 		 383 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  65.27 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  60.1 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  55.99 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  54.01 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  51.57 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  52.37 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3442  aminotransferase  50 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  48.02 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  47.21 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  47.48 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  48.81 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  46.46 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  47.27 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  48.43 
 
 		 387 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  48.92 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.55 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  46.37 
 
 		 395 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  49.34 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  47.71 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  45.33 
 
 		 385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  47.04 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  46.13 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  45 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  44.92 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  46.81 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  44.35 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2072  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  40.64 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  40.37 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  43.4 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  42.63 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  43.62 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.89 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  40.37 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  43.8 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  42.42 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.82 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  43.13 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  40.11 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  45.16 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  46.26 
 
 		 413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  44.35 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.4 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.55 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  43.32 
 
 		 388 aa  285  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  43.43 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  43.43 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  42.68 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.21 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  42.39 
 
 		 391 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 384 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0442  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1319  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 391 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  42.78 
 
 		 391 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.7 
 
 		 386 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.89 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1801  putative aminotransferase  42.51 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  41.77 
 
 		 390 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  44.3 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  42.43 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  44.3 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  42.04 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  42.42 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  42.03 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  42.03 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  41.24 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  42.03 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.71 
 
 		 389 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  40.48 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  41.15 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  41.41 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  40.16 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.29 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  40.05 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  41.94 
 
 		 382 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  43.65 
 
 		 400 aa  275  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>