More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1507 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  100 
 
 
400 aa  831    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  59.95 
 
 
408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  58.79 
 
 
398 aa  481  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  56.71 
 
 
409 aa  478  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  52.03 
 
 
397 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  47.7 
 
 
398 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  45.94 
 
 
395 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  45.57 
 
 
396 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  45.06 
 
 
396 aa  378  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 
399 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 
401 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  42.35 
 
 
396 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
395 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
395 aa  339  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.19 
 
 
395 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  34.44 
 
 
396 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 
373 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.06 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.42 
 
 
390 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  33.25 
 
 
396 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 
402 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  33.06 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  32.23 
 
 
396 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  31.12 
 
 
405 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 
404 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 
405 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  32.79 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  28.07 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  29.15 
 
 
397 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  30.1 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.16 
 
 
395 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  32.99 
 
 
401 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 
395 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 
400 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.38 
 
 
395 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  27.68 
 
 
399 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 
395 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 
386 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 
395 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  33.54 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 
386 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  30.57 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  33.12 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 
397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  30.31 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  31.38 
 
 
407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
392 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.37 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  30.17 
 
 
398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  32.8 
 
 
400 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.34 
 
 
388 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  31.39 
 
 
400 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 
396 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 
387 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 
382 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  30.2 
 
 
397 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  32.3 
 
 
390 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
381 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
387 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  32.54 
 
 
386 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.23 
 
 
392 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 
374 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.62 
 
 
385 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 
385 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
383 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 
400 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  31.01 
 
 
391 aa  159  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
386 aa  159  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
386 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.48 
 
 
393 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
386 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 
400 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  29.24 
 
 
396 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  30.57 
 
 
400 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  30.23 
 
 
396 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.52 
 
 
393 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  32.09 
 
 
404 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  29.8 
 
 
393 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  27.78 
 
 
387 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 
400 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  30.5 
 
 
400 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  28.4 
 
 
398 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.69 
 
 
370 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
397 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  26.93 
 
 
397 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>