More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1646 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 408 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  59.95 
 
 		 400 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  57.79 
 
 		 398 aa  491  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  54.18 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  51.78 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  46.45 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  45.43 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  46.29 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  45.01 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  43.22 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  41.47 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 		 401 aa  299  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.68 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.23 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  30.63 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  31 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  33.95 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  31.64 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  32.72 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  30.05 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  30.64 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  33.84 
 
 		 400 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  30.09 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  32.39 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  33.75 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  28.89 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  34.12 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  29.7 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 		 385 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  32.52 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  32.52 
 
 		 400 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  27.09 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  30.4 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  31.9 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  32.92 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  30.33 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.1 
 
 		 383 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  32.2 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.23 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  31.55 
 
 		 387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  29.93 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  28.25 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.42 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  32.39 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  31.16 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  32.81 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 		 377 aa  163  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  29.16 
 
 		 401 aa  163  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.07 
 
 		 377 aa  163  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  28.75 
 
 		 390 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  27.9 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  29.35 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.91 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  31.68 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  31.75 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  29.5 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.19 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  29.06 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  28.82 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  28.77 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.2 
 
 		 390 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 		 400 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>