More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1182 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  92.15 
 
 
396 aa  764    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  815    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  72.01 
 
 
396 aa  593  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  59.49 
 
 
401 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 
409 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
395 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
395 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  49.23 
 
 
397 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  47.59 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  47.83 
 
 
396 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  49.1 
 
 
399 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  48.59 
 
 
398 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  45.94 
 
 
400 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  46.45 
 
 
408 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  42.96 
 
 
401 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  34.63 
 
 
384 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 
384 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  32.27 
 
 
404 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
405 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  30.13 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.86 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
397 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  34.83 
 
 
375 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.19 
 
 
395 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  35.14 
 
 
375 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  32.06 
 
 
402 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  27.34 
 
 
399 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  30.25 
 
 
397 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.31 
 
 
370 aa  176  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  32.82 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  29.8 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  30.05 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.42 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  32.79 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  28.54 
 
 
396 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  32.52 
 
 
387 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  32.78 
 
 
385 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  33.06 
 
 
387 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  31.38 
 
 
399 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
407 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  31.21 
 
 
416 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  32.25 
 
 
387 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.41 
 
 
396 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  33.22 
 
 
398 aa  169  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  33.25 
 
 
388 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  31.98 
 
 
387 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.52 
 
 
385 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  32.23 
 
 
387 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  31.96 
 
 
387 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
388 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  31.96 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  31.96 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  29.9 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  28.06 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  33.23 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.93 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.93 
 
 
396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  31.65 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.19 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  30.2 
 
 
392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.73 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  30.2 
 
 
392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.93 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  35.8 
 
 
411 aa  162  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  32.41 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  31.1 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 
380 aa  162  9e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.17 
 
 
392 aa  161  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  29.01 
 
 
391 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  32.41 
 
 
379 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  33.43 
 
 
373 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  32.6 
 
 
394 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 
379 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.37 
 
 
392 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.34 
 
 
393 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  29.72 
 
 
399 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 
385 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  31.09 
 
 
385 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 
378 aa  160  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  28.28 
 
 
400 aa  159  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  28.09 
 
 
403 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.53 
 
 
367 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.74 
 
 
386 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  30.06 
 
 
398 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  28.43 
 
 
393 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  27.99 
 
 
395 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  29.7 
 
 
393 aa  157  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  28.88 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.79 
 
 
396 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
389 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.13 
 
 
387 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  27.53 
 
 
405 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>