More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07891 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  100 
 
 
409 aa  843    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2271  aspartate aminotransferase  64.99 
 
 
398 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.738688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1623  aspartate aminotransferase  60.41 
 
 
397 aa  524  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.399039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1507  aspartate aminotransferase  56.71 
 
 
400 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1646  aspartate aminotransferase  54.18 
 
 
408 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1182  aspartate aminotransferase  51.41 
 
 
395 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.410689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0063  aspartate aminotransferase  51.15 
 
 
396 aa  431  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1242  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
396 aa  418  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0313  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
401 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000311454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0519  aminotransferase class I and II  47.57 
 
 
398 aa  388  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2610  aminotransferase class I and II  47.31 
 
 
399 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.63591e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2238  aminotransferase class I and II  46.17 
 
 
396 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0994  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
395 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1136  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
395 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.358682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0549  aminotransferase class I and II  43.29 
 
 
401 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  33.83 
 
 
396 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.94 
 
 
395 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 
396 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  29.61 
 
 
404 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  29.28 
 
 
398 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  33.25 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 
397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  29.06 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  31.12 
 
 
398 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  32.5 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  28.32 
 
 
393 aa  181  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  32.75 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  30.37 
 
 
399 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 
388 aa  179  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 
373 aa  179  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  31.51 
 
 
392 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  33.33 
 
 
392 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  32.73 
 
 
393 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  29.41 
 
 
399 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  30.45 
 
 
396 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  31.69 
 
 
399 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
385 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  31.25 
 
 
400 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.91 
 
 
392 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 
417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  29.53 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  30.83 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  29.37 
 
 
403 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  26.96 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  31.7 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  30.3 
 
 
393 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  29 
 
 
398 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  26.59 
 
 
402 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  31.74 
 
 
375 aa  172  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  29.02 
 
 
405 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
402 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  29.4 
 
 
400 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.65 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
416 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.07 
 
 
405 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 
397 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0446  aminotransferase  29.41 
 
 
389 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  29.9 
 
 
395 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.97 
 
 
385 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  26.95 
 
 
392 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.57 
 
 
386 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  28.86 
 
 
409 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  30.05 
 
 
385 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 
404 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  28.97 
 
 
375 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2796  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
409 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482676  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.65 
 
 
390 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  28.72 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29.24 
 
 
375 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  28.7 
 
 
392 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  30.85 
 
 
393 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 
386 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  29.38 
 
 
400 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  32.25 
 
 
379 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 
387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  29.54 
 
 
402 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  28.41 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  31.78 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  32.03 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  32.03 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  29.84 
 
 
392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  29.61 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  28.99 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  32.03 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  30.48 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  27.93 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  31.57 
 
 
508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  27.96 
 
 
452 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  31.96 
 
 
395 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
386 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>