More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2412 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  64.74 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  63.95 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  61.76 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  59.85 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  41.01 
 
 		 395 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  40.46 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  43.77 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  39.95 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  36.88 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  40.72 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  36.72 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  39.18 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  36.13 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  40.46 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  36.29 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  35.49 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  35.54 
 
 		 391 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  34.51 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  34.05 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  29.37 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  31.12 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  27.67 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  33.14 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  29.21 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  33.04 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.07 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  27.84 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.76 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  31.51 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  28.83 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  26.22 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  28.69 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.79 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  25.97 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  28.34 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.06 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  28.65 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  29.78 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  29.01 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  29.67 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  25.07 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  27.15 
 
 		 394 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 412 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  30.17 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  29.79 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  27.82 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  29.65 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  31.79 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  28.35 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  28.69 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  28.49 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  30.2 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  28.69 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  31.21 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  26.9 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.86 
 
 		 444 aa  112  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  26.26 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  28.84 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  30.86 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.89 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  26.03 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  29.48 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  27.79 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  29.31 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.45 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  29.64 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  24.8 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  26.12 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  28.53 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  26.4 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  24.65 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  26.48 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  29.69 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  26.67 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  27.2 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.33 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  24.1 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  27.2 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  30.35 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  26.32 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  30.35 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89248  predicted protein  26.27 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.113989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  27.37 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  27.1 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>