More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1485 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 375 aa  778    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  54.76 
 
 		 410 aa  424  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  53.05 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  55.94 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  46.54 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  50.4 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  46.01 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  49.19 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  50.7 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  50 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  50 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  45.26 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  49.6 
 
 		 398 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  47.17 
 
 		 394 aa  338  9e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  46.9 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  46.15 
 
 		 394 aa  332  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  48.27 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  46.95 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  46.07 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  48.07 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  45.8 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  46.61 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  45.53 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  48.39 
 
 		 398 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  47.06 
 
 		 390 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  46.83 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  48.39 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  47.71 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  47.71 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  47.47 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  47.58 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  47.31 
 
 		 398 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  47.85 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  44.57 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  47.44 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  45.38 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  42.78 
 
 		 394 aa  308  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  47.71 
 
 		 397 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  47.71 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  47.71 
 
 		 460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  43.28 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  48.02 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  43.48 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  42.74 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  43.43 
 
 		 390 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  43.43 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  42.78 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  42.93 
 
 		 390 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  43.13 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  42.28 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  41.73 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  39.07 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  38.95 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.67 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  39.24 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  41.3 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  40.76 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.53 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  40.9 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.43 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  40 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.59 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  39.2 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  39.41 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  37.9 
 
 		 399 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  39.29 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  36.49 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  36.04 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  38.04 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  36.44 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  35.69 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  38.01 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  38.32 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  35.05 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  38.59 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  38.59 
 
 		 387 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  37.09 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  41 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>