More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0865 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  778    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  71.13 
 
 		 383 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  71.13 
 
 		 383 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  69.47 
 
 		 378 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  70 
 
 		 383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  66.93 
 
 		 381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  63.45 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  56.42 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  55.82 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  56.35 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  55.03 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  56.46 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  53.74 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  54.23 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  53.44 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  52.55 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  52.82 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  52.53 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  51.6 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  51.5 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  50.91 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  48.8 
 
 		 390 aa  362  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  51.6 
 
 		 384 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  47.26 
 
 		 384 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  50.93 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  47.52 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  48.66 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  48.66 
 
 		 387 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  47.41 
 
 		 388 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  46.01 
 
 		 382 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  49.07 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  47.09 
 
 		 395 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  46.92 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  46.2 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  45.53 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  47.24 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  44.41 
 
 		 385 aa  324  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  47.24 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  46.05 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  47.86 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.56 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  44.47 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  42.08 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  42.2 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  41.62 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  44.03 
 
 		 388 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 		 388 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  42.02 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  41.69 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  43.32 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.74 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  43.58 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.7 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.37 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  41.84 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  37.11 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  38.52 
 
 		 381 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  40 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  41.71 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  41.36 
 
 		 400 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  40.32 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  41.44 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  39.12 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  39.1 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  40.48 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  41.32 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.1 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  38.34 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  36.32 
 
 		 396 aa  256  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  39.36 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  39.28 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  38.3 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.01 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.18 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  39.89 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  37.63 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.21 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 375 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  37.04 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.83 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  38.5 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  40.16 
 
 		 390 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  40.64 
 
 		 414 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  38.36 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.59 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  40.11 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  39.58 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>