More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0710 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  90.1 
 
 		 394 aa  699    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  79.64 
 
 		 393 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  90.86 
 
 		 394 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  76.84 
 
 		 393 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  74.42 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  73.26 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  72.02 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  74.35 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  71.24 
 
 		 398 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  74.48 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  73.7 
 
 		 398 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  73.52 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  73.52 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  73.52 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  73.52 
 
 		 416 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  73.52 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  73.52 
 
 		 397 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  73.96 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  73.52 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  72.92 
 
 		 398 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  72.92 
 
 		 398 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  72.92 
 
 		 398 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  57.22 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  57 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  57.93 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  56.74 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  55.33 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  57.83 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  56.41 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  51.69 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  54.48 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  52.96 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  53.77 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  51.69 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  52.09 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  53.12 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  51.31 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  50 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  52.08 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  51.81 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  51.05 
 
 		 390 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  49.21 
 
 		 385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  51.69 
 
 		 391 aa  356  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  48.7 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  51.17 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  52.62 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  49.87 
 
 		 389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  52.36 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  51.17 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  46.15 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  44.88 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  45.99 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  43.88 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  47.35 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  42.59 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.36 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  46.43 
 
 		 399 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  46.95 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.12 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  43.56 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  39.49 
 
 		 384 aa  278  9e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  40.77 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 		 385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  42.37 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  40.05 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  35.75 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  40.84 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  40.21 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  38.54 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  38.46 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  38.54 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.05 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  38.96 
 
 		 412 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  37.24 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  39.16 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  40.71 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  38.79 
 
 		 406 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  39.18 
 
 		 395 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  37.47 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  37.34 
 
 		 384 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  37.17 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  40.99 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  36.81 
 
 		 384 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 		 395 aa  235  9e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  37.01 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  37.04 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  36.59 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>