More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4690 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  97.18 
 
 		 390 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  85.05 
 
 		 390 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  97.69 
 
 		 390 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  84.79 
 
 		 390 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  85.9 
 
 		 390 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  787    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  84.58 
 
 		 393 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  95.64 
 
 		 390 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  84.32 
 
 		 390 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  84.06 
 
 		 390 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  85.49 
 
 		 391 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  80 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  81.36 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  56.99 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  60.32 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  56.42 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  56.92 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  49.35 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  48.57 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  51.05 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  55.64 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  51.05 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  51.31 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  51.17 
 
 		 394 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  51.05 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  48.05 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  50.52 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  52.55 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  46.37 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  50.92 
 
 		 398 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  50.39 
 
 		 398 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  50.66 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  49.74 
 
 		 398 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  49.74 
 
 		 398 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  50.66 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  51.05 
 
 		 416 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  51.05 
 
 		 460 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  51.05 
 
 		 397 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  49.74 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  47.42 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  50.13 
 
 		 393 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  45.52 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  44.68 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  46.67 
 
 		 398 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  45.36 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  42.14 
 
 		 410 aa  319  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  44.87 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  44.39 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  44.62 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 		 400 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  44.07 
 
 		 407 aa  309  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  42.93 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  44.99 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  44.53 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  42.23 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  45.05 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  41.78 
 
 		 383 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  44.79 
 
 		 385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  38.99 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  42.52 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  38.2 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.21 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  41.82 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.11 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 379 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 406 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  42.67 
 
 		 381 aa  272  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  42.37 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  43.01 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.7 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.11 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  40.37 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.3 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  43.49 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.64 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  41.05 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.27 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  41.05 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  42.93 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  40.72 
 
 		 396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  40.72 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  41.04 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  40.58 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.93 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  39.25 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  42.34 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>