More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0836 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  95.36 
 
 		 390 aa  733    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  794    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  85.6 
 
 		 393 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  87.11 
 
 		 390 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  86.86 
 
 		 390 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  85.82 
 
 		 390 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  86.08 
 
 		 390 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  86.01 
 
 		 391 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  84.79 
 
 		 390 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  84.28 
 
 		 390 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  84.02 
 
 		 390 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  79.17 
 
 		 394 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  78.48 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  60.58 
 
 		 388 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  59.41 
 
 		 386 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  54.86 
 
 		 385 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  56.66 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  48.57 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  51.69 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  52.63 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  51.57 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  51.05 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  47.79 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  50.79 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  51.31 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  50.79 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  53.08 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  54.33 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  46.29 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  47.94 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  50.92 
 
 		 398 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  50.66 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  50.79 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  50.92 
 
 		 414 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  50.53 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  50.53 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  50.13 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  50.39 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  50.52 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  50.52 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  50.52 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  50.52 
 
 		 460 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  50.52 
 
 		 416 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  50.52 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  50.52 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  45.92 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  46.01 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  45.52 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  45.13 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  46.42 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  44.62 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  42.18 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  46.15 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  45.26 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  45.74 
 
 		 392 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  45.48 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  45.1 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  45.05 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  43.7 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  42.49 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  42.04 
 
 		 383 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  46.49 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  43.75 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  43.49 
 
 		 387 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 		 379 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  40.8 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.47 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.38 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.06 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  43.31 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  39.52 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  42.52 
 
 		 393 aa  282  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  42.82 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  39.1 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  42.71 
 
 		 381 aa  278  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.32 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  40.32 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  39.27 
 
 		 385 aa  276  6e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  40.05 
 
 		 387 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  40.05 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  37.67 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  42.06 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  43.19 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.22 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  38.8 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  41.78 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  42.97 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  40.94 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  41.25 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.56 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  39.25 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  38.81 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  41.87 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>