More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1748 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 395 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  81.41 
 
 		 406 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  80.71 
 
 		 399 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  88.1 
 
 		 395 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  80.71 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  80.1 
 
 		 390 aa  624  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  79.19 
 
 		 395 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  71.65 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  55.94 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  57.48 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  57.48 
 
 		 387 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  59.2 
 
 		 387 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  59.52 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  56.42 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  57.78 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  58.79 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  55.87 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  53.17 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  54.5 
 
 		 387 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  54.5 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  52.63 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  53.91 
 
 		 385 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  52.38 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  53.7 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  53.65 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  52.07 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  48.83 
 
 		 384 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  50.39 
 
 		 381 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  50.79 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  48.31 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  50.68 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  48.56 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  49.21 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  49.21 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  49.21 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  48.16 
 
 		 388 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  48.71 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  48.68 
 
 		 388 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  45.71 
 
 		 388 aa  322  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  45.45 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  48.14 
 
 		 386 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  44.12 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  43.15 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  44.33 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  44.8 
 
 		 382 aa  303  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  42.82 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  43.73 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  46.88 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  46.27 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  44.88 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  45.17 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  41.9 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  42.67 
 
 		 385 aa  279  7e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  40.94 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  43.58 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.53 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  41.21 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.58 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  40.68 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  39.64 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  39.79 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.9 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  39.9 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  36.18 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.03 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.56 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  39.33 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.17 
 
 		 376 aa  250  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  40.58 
 
 		 394 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  38.76 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  40.84 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  41.34 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  40.84 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  41.15 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  35.58 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.79 
 
 		 393 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  40.82 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  39.01 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  41.28 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.88 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  41.28 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 375 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.23 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  37.25 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  40.58 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  38.24 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  40.31 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  39.69 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.68 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  40.31 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  36.27 
 
 		 387 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.46 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  39.14 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  38.16 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  38.26 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  40.36 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  39.03 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>