More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1792 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  100 
 
 		 385 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  68.49 
 
 		 385 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  67.71 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  58.85 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  57.29 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  57.29 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  54.83 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  53.42 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  54.07 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  52.6 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  51.58 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  54.43 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  51.31 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  51.81 
 
 		 384 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  51.3 
 
 		 396 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  48.69 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  47.78 
 
 		 383 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  47.64 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  48.04 
 
 		 383 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  49.47 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  53 
 
 		 390 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  47.93 
 
 		 388 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  48.19 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  49.08 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  46.34 
 
 		 381 aa  322  7e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  47.01 
 
 		 384 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  46.79 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  44.88 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  47.52 
 
 		 391 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  46.43 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  47.69 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  44.18 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  46.04 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  44.47 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  42.02 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  45.85 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  45.85 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  45.85 
 
 		 395 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  41.53 
 
 		 374 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  47.8 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  42.02 
 
 		 385 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  43.78 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  46.98 
 
 		 396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  44.65 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  38.58 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  42.82 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  44.13 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  46.34 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.38 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  43.38 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  42.82 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  43.78 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  43.43 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  42.97 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  43.92 
 
 		 400 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  45.31 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  43.75 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  45.05 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  44.79 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  43.6 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  42.06 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  34.92 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  41.62 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  41.01 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.46 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  37.44 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40.1 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  38.34 
 
 		 387 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  38.2 
 
 		 385 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  37.34 
 
 		 381 aa  239  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  40.21 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  39.79 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.43 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  40.11 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.67 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.49 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  41.03 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  41.03 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  41.03 
 
 		 416 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  41.03 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  41.03 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  41.03 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  41.03 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  39.54 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  39.59 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  39.49 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  40.62 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  36.15 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  36.68 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.27 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>