More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1903 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 396 aa  825    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  46.09 
 
 		 385 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  48.03 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  46.01 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  46.28 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 		 388 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  45.74 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  46.01 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  44.88 
 
 		 390 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  46.86 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  45.01 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  44.65 
 
 		 400 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  45.21 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  44.56 
 
 		 386 aa  322  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  45.74 
 
 		 391 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  44.25 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  40.16 
 
 		 393 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  46.01 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  44.36 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  43.99 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  43.92 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  42.64 
 
 		 397 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  40.1 
 
 		 393 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 		 392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  38.88 
 
 		 410 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  44.47 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  45.74 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  42.59 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  42.59 
 
 		 394 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.05 
 
 		 394 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  45.74 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  42.31 
 
 		 414 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  44.68 
 
 		 390 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.9 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.38 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.48 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  42.42 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  42.42 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  40.21 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  42.42 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  41.06 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.95 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  40.76 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.65 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  42.03 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.97 
 
 		 407 aa  289  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  41.79 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  41.79 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  41.79 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  41.12 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  41.12 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  40.86 
 
 		 394 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  37.91 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  41.79 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  39.01 
 
 		 399 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  38.19 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  38.16 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  33.94 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  36.77 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  36.58 
 
 		 395 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  36.32 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  37.97 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  36.25 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  36.77 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.2 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  36.32 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  36.88 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  37.5 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 390 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  33.59 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  33.85 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  35.98 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  35.71 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  37.43 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  32.99 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  35.66 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  34.12 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  33.95 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  35.83 
 
 		 387 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>