More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6897 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  69.03 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  67.89 
 
 		 384 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  65.35 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  66.49 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  66.49 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  66.49 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  64.3 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  62.02 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  62.03 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  56.33 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  57.47 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  53.39 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  53.44 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  60.05 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  55.87 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  58.87 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  48.95 
 
 		 395 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  48.18 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  48.18 
 
 		 387 aa  352  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  51.23 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  49.47 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  49.47 
 
 		 395 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  48.68 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  48.02 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  48.19 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  48.53 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  47.11 
 
 		 390 aa  335  5.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  44.74 
 
 		 390 aa  335  7e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  47.03 
 
 		 385 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  49.21 
 
 		 383 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 387 aa  332  9e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  46.05 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  47.48 
 
 		 374 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  47.88 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  47.27 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  48.8 
 
 		 387 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  48.7 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  47.62 
 
 		 383 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  51.04 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  46.54 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  44.62 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  47.33 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  41.01 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.11 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.48 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  43.58 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  43.01 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  43.05 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  41.36 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  40.94 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  40.91 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  40.53 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  39.16 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  42.67 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  42.67 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  41.67 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  40.51 
 
 		 391 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  42.25 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.93 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  40.63 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  40.9 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  38.67 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  42.23 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  42.23 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  38.26 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  41.97 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  41.97 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  41.97 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  41.97 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  40.26 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  42.19 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.19 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  41.18 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  41.11 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  37.63 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  39.35 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.93 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  38.07 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.91 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  40.48 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  40.48 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  34.38 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  37.63 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.66 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.76 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 		 376 aa  229  9e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  40.37 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.76 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>