More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0727 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  100 
 
 
382 aa  774    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  71.39 
 
 
381 aa  549  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  68.98 
 
 
385 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  64.05 
 
 
374 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  48.68 
 
 
384 aa  342  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  48.53 
 
 
395 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  46.01 
 
 
381 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 
388 aa  335  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  46.26 
 
 
383 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  47.73 
 
 
386 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  47.48 
 
 
384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  45.99 
 
 
383 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  46.54 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  47.18 
 
 
383 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  48.27 
 
 
395 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  48.27 
 
 
395 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  48.27 
 
 
395 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  45.33 
 
 
388 aa  318  9e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  44.18 
 
 
392 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  45.65 
 
 
393 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  44.8 
 
 
395 aa  316  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  46.65 
 
 
384 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  46.86 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  44.18 
 
 
385 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  45.04 
 
 
387 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 
387 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  44.77 
 
 
387 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  45.91 
 
 
381 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  44.36 
 
 
406 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  44.41 
 
 
395 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  45.31 
 
 
387 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  45.07 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  45.07 
 
 
387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  47.55 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  44.53 
 
 
390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  44 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  44.3 
 
 
385 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  45.07 
 
 
396 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  44.8 
 
 
395 aa  299  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  45.07 
 
 
390 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  44.74 
 
 
393 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  43.5 
 
 
385 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  42.48 
 
 
390 aa  292  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  44.06 
 
 
388 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  43.54 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  45.07 
 
 
396 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.84 
 
 
394 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  45.81 
 
 
391 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  40.84 
 
 
390 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  41.87 
 
 
388 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  42.04 
 
 
390 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  37.84 
 
 
436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.36 
 
 
390 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  39.63 
 
 
390 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 
392 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.73 
 
 
400 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  38.26 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  38.2 
 
 
385 aa  240  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  40.21 
 
 
393 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.96 
 
 
394 aa  239  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  41.95 
 
 
390 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.2 
 
 
390 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  39.68 
 
 
390 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  41.05 
 
 
391 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  40.58 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.2 
 
 
400 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  40.41 
 
 
398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.27 
 
 
397 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.55 
 
 
400 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  35.88 
 
 
388 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  41.01 
 
 
390 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  34.46 
 
 
383 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.76 
 
 
393 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  40.74 
 
 
390 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  40.74 
 
 
390 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  37.7 
 
 
396 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  35.51 
 
 
376 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.74 
 
 
394 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  37.99 
 
 
394 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
387 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  39.31 
 
 
390 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  34.04 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.99 
 
 
393 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  35 
 
 
385 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  38.54 
 
 
398 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  38.58 
 
 
398 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  37.86 
 
 
394 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  39.01 
 
 
397 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
398 aa  223  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  37.17 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  32.71 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  38.22 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  38.32 
 
 
398 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  39.12 
 
 
460 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  39.12 
 
 
397 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>