More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0911 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  100 
 
 
387 aa  789    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  91.21 
 
 
412 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  99.74 
 
 
387 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  60.42 
 
 
385 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  59.64 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  57.81 
 
 
385 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  55.03 
 
 
395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  56.05 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  55.61 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  55.24 
 
 
390 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  52.77 
 
 
390 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  55.24 
 
 
399 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  56.02 
 
 
387 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  53.83 
 
 
393 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  54.5 
 
 
395 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  54.19 
 
 
396 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  52.11 
 
 
387 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  51.58 
 
 
387 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  56.32 
 
 
390 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  53.52 
 
 
384 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  51.97 
 
 
387 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  47.79 
 
 
384 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  47.67 
 
 
384 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  47 
 
 
388 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  48.66 
 
 
381 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  47.79 
 
 
392 aa  342  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  46.88 
 
 
383 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  48.18 
 
 
388 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  48.44 
 
 
388 aa  339  5e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  47 
 
 
383 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  47.88 
 
 
395 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  46.98 
 
 
395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  46.98 
 
 
395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  46.98 
 
 
395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  48.67 
 
 
386 aa  329  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  45.69 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  47.37 
 
 
391 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  47.23 
 
 
383 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  46.58 
 
 
381 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 
393 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  46.68 
 
 
378 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  43.77 
 
 
381 aa  316  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  44.59 
 
 
385 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  45.07 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  44.44 
 
 
374 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  45.91 
 
 
389 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  43.75 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.53 
 
 
394 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  47.51 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 
396 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  40.58 
 
 
390 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  44.7 
 
 
391 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  40.43 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  41.45 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.6 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  40.84 
 
 
436 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  43.4 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  40.05 
 
 
390 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  39.52 
 
 
390 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  39.85 
 
 
390 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  38.79 
 
 
385 aa  256  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.41 
 
 
376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.31 
 
 
384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  40.41 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  40.1 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  41.8 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  39.78 
 
 
400 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  39.74 
 
 
396 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.34 
 
 
394 aa  247  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
379 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  41.01 
 
 
398 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  41.1 
 
 
394 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  41.1 
 
 
394 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.22 
 
 
394 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.92 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.4 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  40.69 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.63 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.11 
 
 
393 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  35.51 
 
 
381 aa  242  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
410 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  41.32 
 
 
390 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  39.69 
 
 
391 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  41.32 
 
 
390 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  41.05 
 
 
390 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  38.54 
 
 
394 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  39.34 
 
 
398 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  38.81 
 
 
394 aa  237  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  39.44 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  39.21 
 
 
397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  38.34 
 
 
394 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  39.09 
 
 
398 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  39.29 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.8 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  39.29 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  35.9 
 
 
396 aa  233  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  37.15 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  39.12 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  39.42 
 
 
398 aa  232  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>