More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2980 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  100 
 
 		 383 aa  766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  90.58 
 
 		 383 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  98.96 
 
 		 383 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  74.8 
 
 		 378 aa  562  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  71.13 
 
 		 381 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  68.32 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  67.8 
 
 		 391 aa  484  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  56.73 
 
 		 393 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  54.5 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  53.37 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  53.44 
 
 		 395 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  54.71 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  53.4 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  53.44 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  53.54 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  52.38 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  52.37 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  52.11 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  49.35 
 
 		 412 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 		 387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  51.71 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  51.05 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  48.03 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 		 385 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  48.84 
 
 		 393 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  47.26 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  48.83 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  47.26 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  51.53 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  48.04 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  51.58 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  48.44 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  48.04 
 
 		 384 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  46.72 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  45.99 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  48 
 
 		 381 aa  332  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  49.07 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  48.03 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  48.03 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  48.03 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  44 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  44.68 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  43.32 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  47.62 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  43.64 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  44.22 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  45.81 
 
 		 385 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  43.46 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  48.67 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  44.97 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  45.31 
 
 		 400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  41.73 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 		 381 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  42.14 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  44.8 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 379 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  39.16 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  41.38 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  41.11 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  41.44 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  41.21 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  41.76 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  42.26 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  43.52 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  43.88 
 
 		 400 aa  262  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  43.19 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  38.69 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  40.72 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  42.78 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  41.21 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  41.78 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  42.22 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  42.41 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  41.88 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  42.89 
 
 		 394 aa  252  9.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  36.77 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  40.9 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  41.43 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  41.1 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  41.75 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  41.11 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.78 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.95 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  40.99 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  41.95 
 
 		 414 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.69 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  42.22 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  40.93 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  41.95 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  41.95 
 
 		 398 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>