More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2259 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  802    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  86.26 
 
 		 394 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  83.46 
 
 		 398 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  85.5 
 
 		 394 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  99.24 
 
 		 394 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  78.59 
 
 		 398 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  78.14 
 
 		 398 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  75.9 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  61.96 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  65.24 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  59.64 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  56.67 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  59.64 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  56.01 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  59.39 
 
 		 398 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  56.23 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  56.85 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  55.58 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  57.11 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  57.11 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  57.11 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  57.11 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  57.11 
 
 		 416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  57.11 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  56.85 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  57.11 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  56.85 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  56.85 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  56.6 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  56.6 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  55.92 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  55.92 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  55.67 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 375 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  47.3 
 
 		 385 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  45.13 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  46.04 
 
 		 390 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  47.69 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  43.9 
 
 		 410 aa  329  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  47.84 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  45.38 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  45.38 
 
 		 393 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  45.64 
 
 		 394 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  46.7 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  47.5 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  47.84 
 
 		 389 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  44.1 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  45.9 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  45.78 
 
 		 390 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  46.95 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  44.02 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  46.15 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.68 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  41.71 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  44.87 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  44.87 
 
 		 390 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  46.25 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  44.62 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  41.12 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  38.86 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 		 385 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  43.93 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  36.95 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  41.27 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  41.1 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 365 aa  255  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  41.1 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.28 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.76 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  35.82 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  41.48 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  42.12 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.79 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.39 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  41.28 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  38.93 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  39.49 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  41.73 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  41.22 
 
 		 387 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  39.49 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.74 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  39.23 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  43.05 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  42.12 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  39.33 
 
 		 378 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 385 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  41.94 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  37.91 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 395 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  41.62 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  39.23 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  39.03 
 
 		 385 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>