More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4784 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  82.54 
 
 
384 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  81.36 
 
 
384 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  81.63 
 
 
388 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  64.6 
 
 
393 aa  484  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  62.8 
 
 
392 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  66.67 
 
 
388 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  59.89 
 
 
386 aa  451  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  51.56 
 
 
388 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  54.15 
 
 
390 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  53.63 
 
 
389 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  57.52 
 
 
396 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  56.85 
 
 
391 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  52.49 
 
 
395 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  47.79 
 
 
390 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
406 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  49.21 
 
 
395 aa  348  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  49.21 
 
 
390 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
393 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  48.68 
 
 
381 aa  341  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  48.29 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  49.47 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  48.27 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  46.72 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 
390 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  46.46 
 
 
387 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  47.73 
 
 
381 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  47.09 
 
 
381 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  47.89 
 
 
399 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  49.73 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  46.42 
 
 
387 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  46.15 
 
 
387 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  48.03 
 
 
383 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  48.16 
 
 
396 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  46.84 
 
 
374 aa  322  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  46.83 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  46.11 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  49.47 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  46.95 
 
 
385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  46.56 
 
 
387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  48.28 
 
 
390 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  47.24 
 
 
383 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  45.34 
 
 
385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  45.85 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.35 
 
 
394 aa  299  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  41.35 
 
 
436 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  38.36 
 
 
386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  40.99 
 
 
393 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.02 
 
 
394 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  39.48 
 
 
394 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  39.95 
 
 
393 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  40.78 
 
 
388 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  41.9 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  36.6 
 
 
390 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  38.17 
 
 
410 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  42.42 
 
 
398 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  41.49 
 
 
397 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  40.31 
 
 
389 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  40.63 
 
 
392 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  38.96 
 
 
375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 
388 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  37.63 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  41.91 
 
 
416 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  41.91 
 
 
460 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  41.91 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 
396 aa  242  9e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  37.77 
 
 
385 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  38.96 
 
 
394 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  35.64 
 
 
384 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  33.87 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 
399 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  39.9 
 
 
394 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  40.16 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  37.14 
 
 
390 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  39.48 
 
 
396 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.91 
 
 
400 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.42 
 
 
394 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  37.23 
 
 
379 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36 
 
 
365 aa  236  6e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  37.5 
 
 
398 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  37.47 
 
 
393 aa  235  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  37.91 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  37.69 
 
 
394 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.11 
 
 
383 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  39.26 
 
 
400 aa  232  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  38.3 
 
 
400 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.76 
 
 
398 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  36.73 
 
 
398 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 
381 aa  229  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>