More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2006 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  100 
 
 
390 aa  758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  70.47 
 
 
389 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  69.15 
 
 
390 aa  494  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  60.98 
 
 
388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  69.49 
 
 
391 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  52.86 
 
 
384 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  53.23 
 
 
392 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  51.56 
 
 
384 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  56.17 
 
 
388 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  51.45 
 
 
388 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  52.59 
 
 
393 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  50.66 
 
 
386 aa  358  8e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  50.53 
 
 
395 aa  348  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
395 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
395 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  50.66 
 
 
395 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  54.36 
 
 
394 aa  345  6e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  56.77 
 
 
396 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  47.51 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  48.42 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  45.67 
 
 
390 aa  323  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  47.03 
 
 
381 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  47.04 
 
 
395 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  46.46 
 
 
385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  46.09 
 
 
395 aa  318  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  48.69 
 
 
387 aa  319  7e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  47.57 
 
 
406 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  48.69 
 
 
387 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  47.37 
 
 
396 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  45.53 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 
412 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  48.03 
 
 
393 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  45.57 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  47.94 
 
 
385 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 
387 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  49.17 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  47.38 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  42.64 
 
 
381 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  47.24 
 
 
387 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  44.99 
 
 
378 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  43.85 
 
 
381 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  44.7 
 
 
383 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 
390 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  43.01 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  43.62 
 
 
382 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  43.47 
 
 
385 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  44.59 
 
 
391 aa  279  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  43.22 
 
 
436 aa  277  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  43.52 
 
 
383 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  45.17 
 
 
384 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  42.89 
 
 
390 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  41.91 
 
 
374 aa  259  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  40.37 
 
 
386 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  45.26 
 
 
388 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  41.82 
 
 
390 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  42.02 
 
 
393 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.74 
 
 
394 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  43.04 
 
 
390 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  43.01 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  41.02 
 
 
375 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  43.16 
 
 
390 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  42.36 
 
 
400 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  42.34 
 
 
390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  42.18 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  41.84 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  41.99 
 
 
394 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  41.04 
 
 
390 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  41.43 
 
 
399 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 
388 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  41.04 
 
 
390 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40.99 
 
 
400 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  41.04 
 
 
390 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  40.21 
 
 
397 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  41.56 
 
 
392 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  39.41 
 
 
400 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.56 
 
 
407 aa  224  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  36 
 
 
410 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  40.05 
 
 
398 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  39.95 
 
 
460 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  39.95 
 
 
416 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  38.5 
 
 
397 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.76 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  39.28 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  38.28 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  39.16 
 
 
398 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  38.11 
 
 
394 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  36.94 
 
 
385 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  38.73 
 
 
389 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  38.9 
 
 
398 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  39.02 
 
 
398 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  37.66 
 
 
398 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  37.85 
 
 
398 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  32.71 
 
 
365 aa  206  5e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  38.38 
 
 
414 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>