More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0815 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  88.16 
 
 		 397 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  88.16 
 
 		 397 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  98.74 
 
 		 398 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  95.47 
 
 		 398 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  88.16 
 
 		 397 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  88.16 
 
 		 460 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  96.23 
 
 		 414 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  88.16 
 
 		 397 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  89.17 
 
 		 397 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  82.12 
 
 		 398 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  88.16 
 
 		 416 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  81.36 
 
 		 398 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  94.22 
 
 		 398 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  94.22 
 
 		 398 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  88.16 
 
 		 397 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  83.59 
 
 		 397 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  94.22 
 
 		 398 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  74.09 
 
 		 394 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  73.01 
 
 		 394 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  73.96 
 
 		 394 aa  544  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  70.05 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  68.42 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  59.03 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  56.35 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  56.6 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  55.73 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  61.22 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  58.97 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  54.91 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  54.52 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  54.24 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  55.22 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  50.66 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  50.26 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  49.35 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  50.66 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  49.74 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  50.66 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  50.13 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  51.3 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  51.93 
 
 		 400 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  50.79 
 
 		 389 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  51.71 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  52.49 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  50.52 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  50.92 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 400 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  48.55 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  51.18 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  50.66 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  50.92 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  47.59 
 
 		 375 aa  329  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  46.31 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  44.76 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.31 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  47.61 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  48.48 
 
 		 399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.69 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  41.84 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  40 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  36.48 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  41.01 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  40.66 
 
 		 407 aa  272  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.78 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 		 386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  42.51 
 
 		 381 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  37.8 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  40.52 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  42.3 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.78 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.22 
 
 		 395 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  39.09 
 
 		 387 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  39.09 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  38.12 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  40.53 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  39.47 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  40.21 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  40.83 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  39.37 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.54 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  40.57 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.84 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  39.6 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>