More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0958 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  100 
 
 
381 aa  790    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  68.34 
 
 
379 aa  544  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  65.69 
 
 
385 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  62.66 
 
 
383 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  60.16 
 
 
384 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  59.84 
 
 
381 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  53.6 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  52.11 
 
 
398 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  43.46 
 
 
385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  43.57 
 
 
389 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  42.22 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  39.95 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  39.74 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.63 
 
 
390 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.27 
 
 
387 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  41.22 
 
 
390 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  41.27 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  40.78 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.01 
 
 
398 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  39.74 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 
378 aa  272  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.27 
 
 
398 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  41.53 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  41.53 
 
 
398 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  41.53 
 
 
398 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  39.69 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  40.85 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  39.9 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  39.69 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40.16 
 
 
400 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  38.83 
 
 
390 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.98 
 
 
383 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  39.47 
 
 
398 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  39.36 
 
 
393 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  40.69 
 
 
390 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  39.15 
 
 
397 aa  262  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  39.74 
 
 
398 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  38.56 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  38.83 
 
 
394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.11 
 
 
383 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  39.52 
 
 
400 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  38.3 
 
 
391 aa  258  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.1 
 
 
376 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.81 
 
 
388 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  39.63 
 
 
394 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  33.59 
 
 
399 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  37.2 
 
 
388 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  36.76 
 
 
394 aa  256  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  37.44 
 
 
394 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.78 
 
 
400 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.51 
 
 
395 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  40.1 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  38.27 
 
 
381 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  39.29 
 
 
393 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  39.1 
 
 
390 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  36.65 
 
 
393 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  35.35 
 
 
398 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  35.71 
 
 
398 aa  249  8e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  39.89 
 
 
390 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  39.89 
 
 
390 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  36.32 
 
 
393 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  39.5 
 
 
404 aa  248  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  37.17 
 
 
379 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  35.46 
 
 
397 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  37.37 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  37.04 
 
 
394 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  36.58 
 
 
394 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  37.01 
 
 
393 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  39.05 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  35.82 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  38.83 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  36.97 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.67 
 
 
381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  33.08 
 
 
387 aa  244  3e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  36.6 
 
 
393 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  36.75 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  36.08 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 
387 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  36.75 
 
 
379 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  34.69 
 
 
398 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.48 
 
 
382 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  34.95 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  33.85 
 
 
396 aa  240  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.24 
 
 
407 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  39.89 
 
 
386 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>