More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2043 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  772    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  63.52 
 
 		 385 aa  471  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  60.21 
 
 		 390 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  58.76 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  60.43 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  60.58 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  59.89 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  59.02 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  61.5 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  59.36 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  59.74 
 
 		 394 aa  428  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  62.03 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  57.89 
 
 		 394 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  60.58 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  60.96 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  60.7 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  60.7 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  57.98 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  53.39 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  53.23 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  58.03 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  53.63 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  49.74 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  53.89 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  53.12 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  49.49 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  52.45 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  49.22 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  52.07 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  48.03 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  47.63 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  52.59 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  52.59 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  52.59 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  52.59 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  52.59 
 
 		 460 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  52.33 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  52.33 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  51.55 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  49.23 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  51.03 
 
 		 393 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  48.97 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  51.04 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  50.78 
 
 		 398 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  51.3 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  50.78 
 
 		 398 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  51.04 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  51.62 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  50.78 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  47.84 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  47.98 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  47.84 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  47.97 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  47.91 
 
 		 392 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  46.72 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  44.85 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  43.75 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  44.76 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  46.13 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  45.5 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  46.05 
 
 		 406 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  43.86 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  41.87 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  43.43 
 
 		 381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  42.22 
 
 		 381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  44.97 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  42.55 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.56 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  41.18 
 
 		 365 aa  302  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  42.33 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  43.83 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  46.56 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  43.78 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 410 aa  298  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  39.37 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  44.77 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  43.24 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  45.09 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  44.68 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  45.36 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  43.92 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  43.46 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 		 412 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  43.42 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  43.4 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  43.43 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  43.4 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  40.48 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  42.63 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  42.67 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  43.23 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  43.34 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>