More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0824 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  94.97 
 
 		 398 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  87.91 
 
 		 397 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  87.91 
 
 		 397 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  87.91 
 
 		 397 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  87.91 
 
 		 460 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  96.23 
 
 		 414 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  82.83 
 
 		 397 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  87.91 
 
 		 416 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  87.91 
 
 		 397 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  88.92 
 
 		 397 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  81.61 
 
 		 398 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  82.37 
 
 		 398 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  94.97 
 
 		 398 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  87.91 
 
 		 397 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  98.74 
 
 		 398 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  95.21 
 
 		 398 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  94.97 
 
 		 398 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  73.83 
 
 		 394 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  72.75 
 
 		 394 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  73.7 
 
 		 394 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  69.79 
 
 		 393 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  68.95 
 
 		 393 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  59.03 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  55.98 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  56.85 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  56.6 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  60.71 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  58.46 
 
 		 396 aa  411  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  55.42 
 
 		 398 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  54.52 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  54.26 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  54.96 
 
 		 398 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  50.13 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  50.52 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  49.61 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  50.13 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  50.13 
 
 		 393 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  49.48 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  50.13 
 
 		 390 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  51.55 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  52.19 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  51.05 
 
 		 389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  51.71 
 
 		 390 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  50.26 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  51.97 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  50.4 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  48.81 
 
 		 394 aa  338  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  50.92 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  50.39 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  50.66 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  45.03 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  46.04 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  47.87 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  42.31 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  45.76 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  48.73 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  41.65 
 
 		 396 aa  306  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.43 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  41.84 
 
 		 385 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.41 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  40.26 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  40.92 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  36.6 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  41.18 
 
 		 381 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  42.33 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  42.04 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.95 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  41.04 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.06 
 
 		 379 aa  266  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  41.49 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  41.95 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  39.34 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  42.48 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  42.59 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  39.34 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  39.75 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  38.38 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  40.96 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  40.36 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  40.83 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.75 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  41.53 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  39.89 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  40.21 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  40.16 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  34.55 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  38.58 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  39.64 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  39.35 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>