More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2950 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  100 
 
 		 393 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  75.77 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  67.34 
 
 		 394 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  65.33 
 
 		 394 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  65.08 
 
 		 394 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  64.82 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  64.93 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  63.98 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  64.68 
 
 		 398 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  64.82 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  61.62 
 
 		 398 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  62.34 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  61.36 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  57.51 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  60.2 
 
 		 397 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  58.44 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  61.99 
 
 		 398 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  60.97 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  61.48 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  57.83 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  61.48 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  60.71 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  58.44 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  60.71 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  60.45 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  60.45 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  60.45 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  54.55 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  60.45 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  60.45 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  60.45 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  60.45 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  60.46 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  50.39 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  49.61 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  50.77 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  49.87 
 
 		 390 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  49.09 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  48.83 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  49.87 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  48.83 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  50.39 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  49.36 
 
 		 400 aa  340  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  49.74 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  47.95 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  44.27 
 
 		 385 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  50.65 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  46.15 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  50.39 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  50.13 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  43.77 
 
 		 410 aa  325  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  47.06 
 
 		 389 aa  323  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  49.5 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  48.02 
 
 		 375 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  42.09 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  41.06 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  41.79 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.35 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  45.22 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.97 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  37.24 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  36.32 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  40.57 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.08 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.1 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  39.9 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.18 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.39 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  39.69 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  37.63 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  37.63 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  40.78 
 
 		 406 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  35.34 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  39.33 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.08 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  39.33 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  38.64 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  36.8 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  40.63 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  39.63 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  39.74 
 
 		 390 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  38.68 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  37.82 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  39.47 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.05 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  38.02 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  39.58 
 
 		 385 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  38.07 
 
 		 384 aa  232  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  37.6 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>