More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3548 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 399 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  61.93 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  55.58 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  55.94 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  49.26 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  49.13 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  51.12 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  49.75 
 
 		 398 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  48.01 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  50.88 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  50.5 
 
 		 397 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  45.98 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  48.51 
 
 		 398 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  46.53 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  46.49 
 
 		 390 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  47.5 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  49.49 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  47.75 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  48.98 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  48.47 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  48.27 
 
 		 397 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  48.47 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  46.23 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  47.96 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  49.36 
 
 		 398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  46.35 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  49.5 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  49.49 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  49.49 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  48.09 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  47.84 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  47.58 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  49.24 
 
 		 397 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  45.71 
 
 		 390 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  49.24 
 
 		 416 aa  308  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  49.24 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  47.06 
 
 		 394 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  45.99 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  45.01 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  44.27 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  47.58 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  47.58 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  47.33 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  46.23 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  43.49 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  41.77 
 
 		 388 aa  298  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  44.44 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  44.79 
 
 		 390 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  45.31 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  45.48 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  45.57 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  45.57 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  45.05 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  43.86 
 
 		 400 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  41.44 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  38.19 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  44.1 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  42.27 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  41.58 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  40.76 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.31 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  39.28 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  40.56 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  40.15 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  40.72 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  39.85 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  40.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  39.27 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.09 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  39.19 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  39.38 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 		 412 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  37.6 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.44 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  36.57 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  36.76 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  39.12 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.84 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 		 385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  35.11 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.32 
 
 		 379 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  37.5 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  38.06 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  37.5 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  41.22 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  36.16 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>