More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1919 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  100 
 
 
407 aa  835    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  63.08 
 
 
392 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  55.58 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  53.05 
 
 
375 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  48.89 
 
 
410 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  43.7 
 
 
390 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  46.17 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  44.53 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  42.93 
 
 
394 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  44.22 
 
 
390 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  44.22 
 
 
390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  44.76 
 
 
391 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  43.98 
 
 
390 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  43.73 
 
 
393 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  43.18 
 
 
394 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  43.18 
 
 
398 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  43.98 
 
 
394 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  42.68 
 
 
394 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  41.49 
 
 
385 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  42.42 
 
 
398 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  45.22 
 
 
394 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  41.5 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  37.97 
 
 
396 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  44.59 
 
 
390 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  42.56 
 
 
388 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  43.25 
 
 
397 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  39.74 
 
 
393 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  43.98 
 
 
390 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  39.18 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  44.33 
 
 
390 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  43.56 
 
 
390 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  44.07 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  42.38 
 
 
397 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.82 
 
 
388 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  44.41 
 
 
393 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  41.94 
 
 
398 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  40.31 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  43.56 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  42.75 
 
 
394 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.28 
 
 
397 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  43.15 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  40.66 
 
 
398 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.13 
 
 
400 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  40.92 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  39.13 
 
 
386 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  40.51 
 
 
398 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  40.41 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  40.41 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  41.79 
 
 
397 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  41.79 
 
 
397 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  41.79 
 
 
397 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  41.79 
 
 
397 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  41.79 
 
 
416 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  41.79 
 
 
397 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  41.79 
 
 
460 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  40.98 
 
 
398 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  40.41 
 
 
414 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  40.82 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  38.52 
 
 
384 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  39.64 
 
 
398 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  36.09 
 
 
394 aa  252  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  37.73 
 
 
384 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  35.96 
 
 
381 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  36.83 
 
 
379 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  37.6 
 
 
392 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  37.31 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.48 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 
383 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  37.24 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 
389 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.85 
 
 
398 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  35.6 
 
 
388 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  37.11 
 
 
383 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  36.72 
 
 
388 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  33.85 
 
 
383 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 
391 aa  227  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  37.87 
 
 
399 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 
384 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  35.66 
 
 
378 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  36.84 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  36.97 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  36.97 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
412 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  34.97 
 
 
381 aa  219  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  37.33 
 
 
396 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  36.6 
 
 
383 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  34.45 
 
 
381 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  35.42 
 
 
390 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  35.97 
 
 
385 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  34.83 
 
 
395 aa  216  7e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  35.88 
 
 
390 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  35.81 
 
 
387 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  36.94 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 
387 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 
393 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>