More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0659 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  90.1 
 
 		 394 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  806    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  81.12 
 
 		 393 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  79.9 
 
 		 393 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  96.45 
 
 		 394 aa  750    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  74.81 
 
 		 397 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  73.64 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  72.8 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  72.02 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  75.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  75.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  75.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  75.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  75.06 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  75.06 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  75.06 
 
 		 460 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  72.75 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  73.58 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  72.24 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  73.26 
 
 		 398 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  73.01 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  72.24 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  72.49 
 
 		 398 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  57.33 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  56.38 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  58.08 
 
 		 396 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  56.12 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  54.31 
 
 		 394 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  58.44 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  54.02 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  56.67 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  51.05 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  53.44 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  51.93 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  53.39 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  51.57 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  51.81 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  51.15 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  49.48 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  48.7 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  51.57 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  48.42 
 
 		 385 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  48.7 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  51.05 
 
 		 390 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  47.19 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  49.49 
 
 		 389 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  47.17 
 
 		 375 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  46.59 
 
 		 410 aa  342  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  51.57 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  44.53 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  51.05 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  46.97 
 
 		 400 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  42.59 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.98 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  46.97 
 
 		 400 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  47.58 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  39.49 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  38.95 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.32 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.15 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  41.16 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  41.49 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  38.38 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  40.9 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  39.36 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  36.58 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  35.49 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  38.95 
 
 		 392 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 387 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.05 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  40.63 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  39.79 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  41.1 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  38.26 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 		 376 aa  246  6e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  40.99 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  36.98 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  38.34 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  37.76 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  37.76 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  39.28 
 
 		 395 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  37.92 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 		 393 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  36.91 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  40.63 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>