More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3104 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  87.63 
 
 		 397 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  81.36 
 
 		 397 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  96.98 
 
 		 398 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  82.87 
 
 		 398 aa  621  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  82.37 
 
 		 398 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  80.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  80.86 
 
 		 416 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  82.62 
 
 		 414 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  82.37 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  80.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  80.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  82.12 
 
 		 398 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  80.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  82.37 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  80.86 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  82.12 
 
 		 398 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  80.86 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  72.4 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  71.98 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  72.8 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  70.53 
 
 		 393 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  72.02 
 
 		 394 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  60.56 
 
 		 394 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  61.58 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  59.39 
 
 		 394 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  59.39 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  59.85 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2950  aminotransferase  61.62 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00573784  normal  0.780018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  56.93 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  57.14 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3113  aminotransferase  58.54 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.274828  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  55.38 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  51.57 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  52.36 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  51.79 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  50.77 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  50 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  51.57 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  53.63 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  53.21 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  50 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  51.3 
 
 		 389 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  52.11 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  51.57 
 
 		 391 aa  358  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  52.62 
 
 		 390 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  51.83 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  49.21 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  51.31 
 
 		 390 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  51.05 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  50.79 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  45.08 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  47.83 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01041  probable aspartate aminotransferase  45.43 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  48.39 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  44.25 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  43.51 
 
 		 394 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3548  aminotransferase class I and II  49.49 
 
 		 399 aa  319  6e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.855555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  49.09 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  39.07 
 
 		 383 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1919  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  41.94 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  43.05 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  41.54 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  37.98 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  39.02 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  41.71 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  39.74 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  42.41 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  42.78 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  39.12 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  42.41 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  39.02 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  40.74 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  39.84 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  41.39 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  40.69 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  42.41 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  40.69 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  39.58 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  41.93 
 
 		 387 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  40.52 
 
 		 412 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  39.21 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 		 387 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  41.64 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  41.79 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  38.69 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  41.79 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  41.79 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  38.92 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  40.48 
 
 		 388 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  40 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  39.15 
 
 		 385 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.77 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>