More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2423 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  796    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  53.12 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  54.92 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  56 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  54.19 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  54.71 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  54.57 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  53.3 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  54.17 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  52.36 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  54.38 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  54.07 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  53.23 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  53.58 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  51.72 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  50.91 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  52.07 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  53.14 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  55.38 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  53.05 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  50.93 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  52.37 
 
 		 381 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  52.91 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  48.58 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  53.44 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  52.49 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  52.49 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  52.49 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  51.7 
 
 		 387 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  50.52 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  52.39 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  52.49 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  50.39 
 
 		 389 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  48.53 
 
 		 382 aa  352  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 387 aa  349  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  50 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  48.69 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  50.39 
 
 		 384 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  48.95 
 
 		 385 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  54.72 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  49.47 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  47.33 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  47.84 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  47.33 
 
 		 412 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  47.88 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  47.88 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  44.59 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.97 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  44.71 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  43.34 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  41.87 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  43.47 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  41.45 
 
 		 436 aa  268  8.999999999999999e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  42.06 
 
 		 393 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  42.13 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.69 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  41.15 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  40.26 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.35 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  42.97 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  42.29 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.9 
 
 		 385 aa  252  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  41.98 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  39.84 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  42.3 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  34.93 
 
 		 376 aa  249  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  41.25 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.04 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  40.37 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  40.52 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  42.19 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  42.19 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  42.19 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  40.05 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  35.01 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  38.26 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  37.43 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  38.26 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  40.21 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  39.25 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  40.26 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  40.11 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  36.02 
 
 		 365 aa  239  5e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  40.11 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  37.2 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  40.11 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  40.26 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  40.26 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  40.26 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>