More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1660 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1660  aminotransferase class I and II  100 
 
 
390 aa  796    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0744176  normal  0.0229062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  58.95 
 
 
387 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  58.68 
 
 
387 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  55.67 
 
 
395 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  59.01 
 
 
387 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2440  aminotransferase, class I and II  57.26 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1748  aminotransferase, class I and II  55.94 
 
 
395 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0902738  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3944  aminotransferase class I and II  58.95 
 
 
387 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2860  aminotransferase, class I and II  56.61 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3497  aminotransferase class I and II  56.08 
 
 
393 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.683607  normal  0.548543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4206  aminotransferase  56.08 
 
 
390 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3012  aminotransferase, class I and II  55.84 
 
 
395 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250896  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6045  aminotransferase class I and II  59.21 
 
 
390 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2724  aminotransferase class I and II  55.94 
 
 
396 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.273302  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2702  aminotransferase class I and II  56.84 
 
 
384 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496987  normal  0.10024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  51.58 
 
 
385 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  52.77 
 
 
387 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  52.77 
 
 
387 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  53.83 
 
 
412 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  51.84 
 
 
385 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1792  aspartate transaminase  50.26 
 
 
385 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  49.21 
 
 
388 aa  364  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38110  aminotransferase  48.42 
 
 
392 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115353  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 
384 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  48.95 
 
 
381 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2423  aminotransferase  50.93 
 
 
395 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0696639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  47.38 
 
 
384 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  49.73 
 
 
383 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  48.8 
 
 
381 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4784  aspartate aminotransferase  47.79 
 
 
395 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4698  aspartate aminotransferase  47.79 
 
 
395 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.854155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5083  aspartate aminotransferase  47.79 
 
 
395 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.347204  normal  0.420607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  49.73 
 
 
383 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  50 
 
 
383 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  47.79 
 
 
390 aa  339  4e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1629  aminotransferase, class I and II  50 
 
 
389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2932  aminotransferase class I and II  47.61 
 
 
386 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.805427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  46.56 
 
 
378 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  46.68 
 
 
391 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0039  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
389 aa  316  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  44.74 
 
 
388 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0181  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
388 aa  315  7e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0295  aspartate aminotransferase  44.39 
 
 
393 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1395  aminotransferase class I and II  43.67 
 
 
381 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0080  aminotransferase class I and II  46.77 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  42.18 
 
 
374 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2513  aminotransferase  43.55 
 
 
385 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0124388  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43315  predicted protein  40.35 
 
 
436 aa  293  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.863703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  42.48 
 
 
382 aa  292  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2006  aminotransferase class I and II  45.67 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.449815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  40.37 
 
 
394 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5131  aminotransferase class I and II  44.39 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.3 
 
 
376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  40.48 
 
 
388 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.9 
 
 
379 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21140  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.92 
 
 
394 aa  260  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0885  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 
365 aa  259  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  39.08 
 
 
386 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  37.14 
 
 
390 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  38.68 
 
 
400 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  38.34 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  34.91 
 
 
398 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  39.23 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  37.34 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  34.55 
 
 
384 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  40.86 
 
 
400 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  39.78 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  37.82 
 
 
390 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  34.22 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  36.53 
 
 
393 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  36.34 
 
 
390 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  38.3 
 
 
389 aa  234  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  34.44 
 
 
396 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  229  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  37.23 
 
 
393 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  37.4 
 
 
394 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  38.16 
 
 
394 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  37.82 
 
 
398 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
381 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  33.78 
 
 
381 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  36.41 
 
 
394 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  36.87 
 
 
391 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1485  aminotransferase, class I and II  37.09 
 
 
375 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  36.25 
 
 
394 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  37.5 
 
 
397 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  36.08 
 
 
392 aa  222  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  36.34 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  35.96 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  37.05 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  36.64 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  38.02 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  38.18 
 
 
397 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  38.18 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  38.18 
 
 
460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>