More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0455 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  801    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  64.01 
 
 
389 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  63.85 
 
 
391 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  62.82 
 
 
391 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  63.66 
 
 
389 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  63.4 
 
 
389 aa  494  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  39.39 
 
 
391 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  37.85 
 
 
393 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  37.37 
 
 
395 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  38.29 
 
 
392 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  36.18 
 
 
391 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  34.63 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  38.27 
 
 
392 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  38.01 
 
 
392 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  35.47 
 
 
387 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  37 
 
 
390 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  34.99 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  35.49 
 
 
392 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  32.87 
 
 
451 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  36.8 
 
 
393 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 
409 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  32.7 
 
 
400 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  32.96 
 
 
399 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  30.46 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  31.67 
 
 
392 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  31.11 
 
 
396 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.65 
 
 
394 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  28.91 
 
 
388 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  28.65 
 
 
390 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.9 
 
 
390 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28.79 
 
 
387 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.85 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  27.91 
 
 
402 aa  152  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30 
 
 
367 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  29.87 
 
 
401 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  28.05 
 
 
391 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  27.32 
 
 
370 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  28.17 
 
 
381 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
387 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  27.55 
 
 
391 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 
398 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  30.61 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  31.12 
 
 
398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  28.94 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  30.65 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  28.68 
 
 
387 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  29.82 
 
 
394 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.18 
 
 
388 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  26.41 
 
 
396 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 
386 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  26.85 
 
 
396 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  26.85 
 
 
396 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  26.85 
 
 
396 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  26.9 
 
 
396 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  27.44 
 
 
400 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  30 
 
 
414 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  27.73 
 
 
381 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.42 
 
 
387 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  28.68 
 
 
399 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  26.6 
 
 
396 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 
412 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  26.6 
 
 
396 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  26.6 
 
 
396 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  26.6 
 
 
396 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  26.6 
 
 
396 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  26.8 
 
 
396 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 
385 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  29.89 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  30.16 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.76 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.66 
 
 
379 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  29.3 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  27.34 
 
 
396 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 
396 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  27.89 
 
 
412 aa  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  27.81 
 
 
394 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  28.02 
 
 
399 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.33 
 
 
387 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  29.65 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 
385 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  26.63 
 
 
367 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  28.1 
 
 
391 aa  137  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.84 
 
 
397 aa  137  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  27.25 
 
 
401 aa  136  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  26.22 
 
 
383 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.03 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  24.33 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  27.04 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  28.01 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  26.22 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.09 
 
 
410 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  26.17 
 
 
397 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  31.15 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  26.37 
 
 
390 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  27.02 
 
 
371 aa  132  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  27.11 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>