More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4642 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  91.45 
 
 		 387 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  64.74 
 
 		 392 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  59.59 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  60.53 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  44.69 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  39.8 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  39.11 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  42.9 
 
 		 393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  38.06 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  41.01 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  41.26 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  36.79 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  41.27 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  41.53 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  36.31 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  37.77 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  36.58 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  38.23 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  35.47 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  28.91 
 
 		 391 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  31.07 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  27.88 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  33.13 
 
 		 388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  32.17 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  31.18 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  27.62 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  29.01 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.26 
 
 		 417 aa  125  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.69 
 
 		 398 aa  125  9e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.29 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  28.71 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  26.54 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  32.01 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  29.3 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  29.25 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  28.49 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2494  aminotransferase  29.11 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.09 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  28.37 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  29.15 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2967  aminotransferase  29.11 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  30.86 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.76 
 
 		 393 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  27.86 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  24.68 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  25.95 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  29.23 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2817  aminotransferase  28.41 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  27.61 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  32.28 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  29.76 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  30.17 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  27.38 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.38 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  30.55 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.08 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  30.51 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  25.94 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  27.27 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  26.59 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.26 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  29.05 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  29.02 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  30.98 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  29.39 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  27.14 
 
 		 385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  27.41 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  26.96 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  26.96 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.84 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  29.03 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2782  aminotransferase  27.95 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  27.24 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  26.37 
 
 		 413 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  30.43 
 
 		 390 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  27.18 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  28.82 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  27.39 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  24.02 
 
 		 390 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  27.79 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  24.8 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6029  aminotransferase  28.99 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  28.41 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  28.74 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5806  aminotransferase  28.7 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.658046  decreased coverage  0.00092388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  28.16 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>