More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1794 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  775    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  67.52 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  68.48 
 
 		 392 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  68.48 
 
 		 392 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  62.5 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  61.79 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  58.64 
 
 		 391 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  41.27 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  40.05 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  42.56 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  39.74 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  40.97 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  36.9 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  35.4 
 
 		 451 aa  230  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  36.18 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  36.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  34.42 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  34.6 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  34.59 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  34.91 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  35.85 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  29.52 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  31.71 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  29.45 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  31.45 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  29.15 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  32.52 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  31.73 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  27.66 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  26.61 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  30.5 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  35.25 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.27 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  33.44 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  30.77 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 367 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  30.18 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.46 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.86 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.46 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.78 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  28.84 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.3 
 
 		 393 aa  120  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  26.33 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.31 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3182  aminotransferase class I and II  34.09 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3083  succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.31 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.027715  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  30.28 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  26.05 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  29.25 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  28.44 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  27.88 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  28.69 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3276  aminotransferase class I and II  33.81 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0253836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  32.51 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  30.38 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  27.8 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  32.41 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  26.73 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  24.5 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  30.94 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.6 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  28.03 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  28.02 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  30.96 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  30.06 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  31.81 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  29.35 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0962  aminotransferase  27.93 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  25.07 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  25.85 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  25.85 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  27.12 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  31.2 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  28.15 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  29.75 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  28.61 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  30.45 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  28.84 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  30.45 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  28.38 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>