More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3133 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  100 
 
 
370 aa  752    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  71.78 
 
 
370 aa  556  1e-157  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  56.95 
 
 
367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  54.12 
 
 
371 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  52.16 
 
 
368 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2821  aminotransferase class I and II  51.3 
 
 
388 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  51.64 
 
 
367 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  51.37 
 
 
373 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  48.79 
 
 
375 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  50.14 
 
 
373 aa  365  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  50.55 
 
 
373 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  51.1 
 
 
373 aa  362  8e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  49.59 
 
 
369 aa  355  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  45.84 
 
 
375 aa  347  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  45.31 
 
 
375 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  45.31 
 
 
375 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  48.11 
 
 
370 aa  339  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  46.45 
 
 
375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  43.13 
 
 
387 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  43.5 
 
 
379 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  43.94 
 
 
374 aa  299  4e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  41.98 
 
 
380 aa  298  9e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  42.2 
 
 
398 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  42.33 
 
 
386 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  40.32 
 
 
400 aa  293  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 
388 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  41.67 
 
 
398 aa  293  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  41.67 
 
 
398 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  39.74 
 
 
396 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  41.04 
 
 
388 aa  293  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  39.68 
 
 
404 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  41.11 
 
 
397 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  38.64 
 
 
396 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  40.11 
 
 
405 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  41.11 
 
 
385 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 
407 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  41.91 
 
 
388 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  37.96 
 
 
390 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  38.44 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  38.12 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  41.23 
 
 
375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.16 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  37.86 
 
 
396 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  41.11 
 
 
393 aa  281  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  40.27 
 
 
377 aa  281  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  40.32 
 
 
380 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 
376 aa  279  7e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.32 
 
 
396 aa  278  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  41.32 
 
 
379 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  40.31 
 
 
392 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  39.26 
 
 
390 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  42.44 
 
 
386 aa  275  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 
387 aa  275  9e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 
387 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  39.02 
 
 
392 aa  272  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  40.34 
 
 
398 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  38.83 
 
 
393 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  38.77 
 
 
399 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  43.06 
 
 
393 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  38.75 
 
 
392 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  39.25 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  39.13 
 
 
390 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  38.89 
 
 
386 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  42.06 
 
 
392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  42.98 
 
 
383 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  42.02 
 
 
388 aa  268  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  39.61 
 
 
392 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  39.49 
 
 
401 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  41.21 
 
 
393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  41.01 
 
 
376 aa  266  5e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  37.57 
 
 
395 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  39.43 
 
 
391 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 
387 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
402 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  42.08 
 
 
396 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
401 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  38.17 
 
 
380 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  39.64 
 
 
390 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  39.35 
 
 
399 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 
399 aa  260  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  38.32 
 
 
386 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 
397 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  37.74 
 
 
380 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  37.33 
 
 
387 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1801  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 
401 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.81932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  41.14 
 
 
398 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 
391 aa  256  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  37.27 
 
 
384 aa  256  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  39.49 
 
 
397 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  41.23 
 
 
380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  40.75 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  39.62 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  38.52 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>