More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2134 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  72.47 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  72.47 
 
 		 392 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  72.47 
 
 		 392 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  63.29 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  63.09 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  61.7 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  41.22 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  44.69 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  43.3 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  41.73 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  40.82 
 
 		 389 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  40.66 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  39.24 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  39.44 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  43.2 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  39.39 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  38.32 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  36.21 
 
 		 451 aa  237  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  39.95 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  30.58 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  29.26 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  34.99 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  34.77 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  34.63 
 
 		 392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  32.83 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  28.69 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  30.86 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  28.53 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  32.12 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  29.63 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 		 383 aa  133  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1791  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.117721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  28.86 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  29.59 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  29.46 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  30.43 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  27.65 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  32.37 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.62 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  29.54 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  28.89 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  28.65 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  32.95 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  32.46 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 374 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  30.14 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  29.94 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07891  aspartate aminotransferase  23.9 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  32.32 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  30.61 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  27.35 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  29.09 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  27.35 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.49 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  32.04 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0643  aminotransferase class I and II  29.81 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  29.63 
 
 		 393 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  28.07 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.97 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.62 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  28.81 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  27.4 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  30.19 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  28.3 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  28.27 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 		 382 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  26.82 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0945  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  29.89 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  29.27 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  30.65 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  28.53 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  32.51 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  28.96 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  30.68 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.17 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  27.98 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3334  putative aminotransferase  29.92 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.946068  hitchhiker  0.000376908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  31.11 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  29.51 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6897  aspartate aminotransferase  30.7 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  30.37 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  28.96 
 
 		 384 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>