More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1888 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  823    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  66.84 
 
 		 398 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  65.82 
 
 		 397 aa  554  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  65.4 
 
 		 397 aa  554  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  64.56 
 
 		 396 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  64.39 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  64.81 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  64.56 
 
 		 395 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  64.56 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  61.36 
 
 		 397 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  55.67 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  51.78 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  51.54 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  50.51 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  51.8 
 
 		 395 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  48.81 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  47.69 
 
 		 394 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  44.96 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  47.24 
 
 		 461 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  42.64 
 
 		 398 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  43.65 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  46.67 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  46.67 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  46.05 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  42.02 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.83 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 		 393 aa  299  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  39.42 
 
 		 394 aa  299  7e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  39.2 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.34 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  35.81 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  31.39 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  32.7 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  32.43 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  33.69 
 
 		 404 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.57 
 
 		 404 aa  166  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.73 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.42 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  31.49 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  34.13 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  31.49 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  33.83 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.82 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.95 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  29.46 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.09 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  30.65 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.3 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  29.13 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  30.83 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.81 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 		 389 aa  155  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  29.58 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  31.66 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  28.64 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  34.77 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  33.07 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  27.42 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.83 
 
 		 389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.47 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.39 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.29 
 
 		 387 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.59 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  30.59 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  30.53 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  28.76 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.61 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  31.13 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.77 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.96 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  32.3 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.51 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  32.23 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.18 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  28.46 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  28.96 
 
 		 395 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  28.46 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  29.51 
 
 		 373 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  31.81 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>