More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1148 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 395 aa  808    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  68.02 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  64.56 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  64.05 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  63.29 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  61.77 
 
 		 398 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  62.63 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  62.53 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  62.37 
 
 		 398 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  63.04 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  54.2 
 
 		 393 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  53.67 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  53.96 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  53.32 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  52.21 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  47.1 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  45.79 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  45.31 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  44.81 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  46.34 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  44.24 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  45.29 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  44.62 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.66 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.4 
 
 		 393 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.03 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  39.15 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.67 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  35.85 
 
 		 403 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  32.27 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  32.27 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 		 375 aa  170  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  29.92 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  29.62 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  34.07 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  31.37 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.56 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.81 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  30.56 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  31.67 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  32.55 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  32.24 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  30.73 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  29.57 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0333  aminotransferase  29.54 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  28.5 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.2 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  31.94 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.44 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.67 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  29.64 
 
 		 379 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  28.45 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  29.64 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  31.68 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  30.34 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  28.79 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  29.49 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.85 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  30.39 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  28.72 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.85 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  28.02 
 
 		 393 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 		 368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  31.27 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  28.43 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  31.04 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  29.61 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  31.02 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0732  aspartate aminotransferase  29.46 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  29.03 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  29.95 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.18 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  29.43 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.78 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  31.32 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>