More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3303 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  100 
 
 
397 aa  795    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  65.64 
 
 
393 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  64.19 
 
 
394 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  62.56 
 
 
396 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  62.18 
 
 
398 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  62.85 
 
 
461 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  59.85 
 
 
398 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  59.6 
 
 
398 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  58.64 
 
 
400 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.41 
 
 
395 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  48.86 
 
 
397 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  47.1 
 
 
395 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  47.56 
 
 
398 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  45.96 
 
 
396 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 
396 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  44.16 
 
 
397 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  47.34 
 
 
393 aa  362  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
397 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  46.58 
 
 
393 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  46.1 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  46.02 
 
 
397 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  45.5 
 
 
397 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  47.18 
 
 
397 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.42 
 
 
395 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  43.41 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  40 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  37.82 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  39.22 
 
 
393 aa  245  8e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  35.43 
 
 
396 aa  245  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  34.81 
 
 
405 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  34.34 
 
 
389 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
389 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  34.62 
 
 
389 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 
404 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 
397 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  29.12 
 
 
403 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.69 
 
 
375 aa  170  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  33.62 
 
 
392 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  32.39 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.54 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  29.54 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.75 
 
 
390 aa  163  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
389 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  32.79 
 
 
397 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  33.99 
 
 
392 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
387 aa  159  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.09 
 
 
367 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  31.11 
 
 
388 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 
386 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  28.46 
 
 
375 aa  156  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  31.82 
 
 
390 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 
407 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.39 
 
 
404 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  30.83 
 
 
393 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2569  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  31.07 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 
387 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  29.23 
 
 
382 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.58 
 
 
392 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  31.2 
 
 
390 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  32.52 
 
 
396 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.58 
 
 
389 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.33 
 
 
392 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
404 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3038  aminotransferase class I and II  32.12 
 
 
406 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000279526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  31.81 
 
 
393 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  30 
 
 
392 aa  149  8e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  29.92 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  31.5 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  27.8 
 
 
402 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 
388 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  31.03 
 
 
388 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.41 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  30.54 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.71 
 
 
373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0674  L-aspartate aminotransferase  28.31 
 
 
392 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  30.95 
 
 
393 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.81 
 
 
381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  29.26 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
392 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 
397 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  30.54 
 
 
392 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  28.95 
 
 
389 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  28.01 
 
 
402 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  32.94 
 
 
410 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  30.13 
 
 
389 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  30.22 
 
 
390 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  28.17 
 
 
403 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.97 
 
 
385 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2047  aminotransferase class I and II  30.27 
 
 
396 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0730244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  27.12 
 
 
388 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3724  aminotransferase class I and II  27.87 
 
 
404 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  30.08 
 
 
384 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  28.2 
 
 
405 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>