More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3287 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  79.09 
 
 		 398 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  96.98 
 
 		 397 aa  794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  77.22 
 
 		 397 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 397 aa  815    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  76.57 
 
 		 397 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  75.7 
 
 		 398 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  73.67 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  65.4 
 
 		 396 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  64.39 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  63.29 
 
 		 395 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  52.79 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  52.82 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  51.64 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  44.16 
 
 		 395 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  46.02 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  43.81 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  44.56 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  44.36 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  41.28 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 		 398 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  42.22 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  43.95 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.57 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  37.6 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  37.3 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  35.55 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.39 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  34.01 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  32.59 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  34.32 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.23 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 		 389 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.31 
 
 		 375 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  30.18 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.32 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  31.88 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.1 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  32.49 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.59 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.46 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  32.59 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.09 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  30.99 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.85 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  29.68 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.81 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.93 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  30.67 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.19 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  30.57 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  32.07 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  30.67 
 
 		 396 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  31.4 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.19 
 
 		 387 aa  149  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  30.1 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  31.18 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.47 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.33 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  28.8 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.11 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>