More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02010 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  100 
 
 
393 aa  807    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  60.56 
 
 
395 aa  499  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  59.18 
 
 
393 aa  465  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  56.63 
 
 
394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  45.34 
 
 
396 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 
395 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  41.73 
 
 
398 aa  329  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  42.11 
 
 
393 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 
395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  40.53 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  40 
 
 
393 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  39.68 
 
 
396 aa  299  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  40.56 
 
 
396 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 
397 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  37.06 
 
 
397 aa  293  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 
395 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  38.95 
 
 
393 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  38.5 
 
 
396 aa  289  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  39.1 
 
 
397 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  39.52 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  37.83 
 
 
396 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 
394 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  38.42 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  39.04 
 
 
393 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  37.3 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  36.8 
 
 
397 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  36.51 
 
 
398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  38.85 
 
 
461 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  34.93 
 
 
397 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
400 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  37.93 
 
 
398 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 
398 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.89 
 
 
404 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
397 aa  177  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  30.42 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  30.37 
 
 
394 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  30.54 
 
 
384 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 
384 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
389 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  27.95 
 
 
373 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  28.34 
 
 
399 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  30.27 
 
 
391 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
387 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  27.98 
 
 
403 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  31.37 
 
 
389 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
389 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  29.24 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  29.19 
 
 
377 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
404 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  30.91 
 
 
404 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 
390 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  29.19 
 
 
387 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  29.19 
 
 
387 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  29.12 
 
 
387 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  27.59 
 
 
389 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  26.98 
 
 
388 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0642  aminotransferase class I and II  29.8 
 
 
380 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  28.53 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  28.92 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.06 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  28.38 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  28.42 
 
 
396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.73 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  27.59 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
392 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  28.65 
 
 
385 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  28.92 
 
 
387 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  28.42 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  28.42 
 
 
377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  31.1 
 
 
381 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
389 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.33 
 
 
389 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  31.82 
 
 
379 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  28.65 
 
 
387 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  27.85 
 
 
405 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  28.65 
 
 
387 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 
392 aa  144  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  27.32 
 
 
379 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  28.11 
 
 
387 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
382 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  29.52 
 
 
391 aa  143  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 
410 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.5 
 
 
385 aa  142  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.88 
 
 
388 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  28.98 
 
 
393 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  29.01 
 
 
395 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0044  aromatic amino acid aminotransferase  27.74 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  27.84 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  30.1 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  27.47 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.73 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  29.24 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  30.42 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.29 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  27.56 
 
 
397 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  28.43 
 
 
395 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  26.23 
 
 
391 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>