More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1171 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  100 
 
 
396 aa  811    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  59.54 
 
 
395 aa  475  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  55.67 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  52.91 
 
 
397 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  54.08 
 
 
396 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  52.67 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  52.21 
 
 
395 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  52.59 
 
 
398 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  52.53 
 
 
398 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  51.39 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  51.8 
 
 
397 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
397 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  50.38 
 
 
397 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  51.29 
 
 
394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  50.77 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  48.2 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  47 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  47.98 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  48.86 
 
 
398 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  47.95 
 
 
461 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  47.21 
 
 
393 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  48.45 
 
 
398 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  51.27 
 
 
398 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  51.27 
 
 
398 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  46.33 
 
 
395 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 
400 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  40.56 
 
 
393 aa  295  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  37.66 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  36.81 
 
 
396 aa  276  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  38.28 
 
 
393 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.43 
 
 
397 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.89 
 
 
405 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  31.9 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 
404 aa  196  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.03 
 
 
389 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 
375 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
375 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  29.06 
 
 
373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  31.82 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  30.37 
 
 
373 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  30.93 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 
397 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 
410 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 
390 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 
389 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  31.35 
 
 
397 aa  160  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0102863 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  29.37 
 
 
375 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  33.25 
 
 
370 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  31.46 
 
 
396 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  29.1 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.95 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.59 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.59 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 
396 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  31.11 
 
 
396 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  31.46 
 
 
396 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  29.41 
 
 
390 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  31.04 
 
 
396 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  29.95 
 
 
404 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  30.85 
 
 
396 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 
393 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0079  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  31.23 
 
 
400 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  31.11 
 
 
394 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  29.67 
 
 
392 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1353  L-aspartate aminotransferase  31.71 
 
 
391 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  30.55 
 
 
392 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  30.19 
 
 
388 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  29.79 
 
 
402 aa  150  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
373 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  28.72 
 
 
373 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2821  aminotransferase class I and II  29.22 
 
 
388 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128266  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  28.65 
 
 
415 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 
392 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 
404 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  29.89 
 
 
390 aa  149  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  30.22 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.79 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  30.77 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  31.15 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  29.33 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  29.95 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  30.57 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  30.23 
 
 
400 aa  147  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>