More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3530 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  100 
 
 
373 aa  776    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  36.53 
 
 
375 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  36.53 
 
 
375 aa  257  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  36 
 
 
375 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  35.73 
 
 
375 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 
375 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.32 
 
 
390 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  37.74 
 
 
385 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  37.05 
 
 
396 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  36.27 
 
 
396 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  35.11 
 
 
370 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  36.46 
 
 
396 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  36.83 
 
 
396 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  36.2 
 
 
396 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  35.99 
 
 
369 aa  225  8e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  36.01 
 
 
396 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  33.07 
 
 
391 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  35.05 
 
 
367 aa  222  7e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  34.41 
 
 
383 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  35.19 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  35.86 
 
 
390 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  34.76 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.68 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 
381 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
385 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  36.91 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 
368 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  34.54 
 
 
386 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  33.95 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  31.84 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  34.64 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
387 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  34.67 
 
 
390 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  34.71 
 
 
391 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  34.03 
 
 
392 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  34.03 
 
 
392 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  35.25 
 
 
384 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
381 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 
387 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  34.05 
 
 
371 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  34.91 
 
 
396 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
387 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  34.46 
 
 
387 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  31.41 
 
 
398 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 
402 aa  205  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  34.91 
 
 
382 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  32.47 
 
 
388 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  34.28 
 
 
388 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 
386 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  34.2 
 
 
385 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  34.48 
 
 
381 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  36.67 
 
 
387 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  34.2 
 
 
387 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  33.68 
 
 
386 aa  203  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  34.41 
 
 
373 aa  203  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  34.73 
 
 
401 aa  203  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  32.46 
 
 
398 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  34.2 
 
 
387 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  34.72 
 
 
382 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  34.2 
 
 
387 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  33.94 
 
 
387 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  34.21 
 
 
387 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  35 
 
 
405 aa  202  9e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  32.2 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 
407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  33.94 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  32.72 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  33.94 
 
 
387 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  33.94 
 
 
387 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  32.28 
 
 
387 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.36 
 
 
404 aa  199  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
400 aa  199  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  35.87 
 
 
370 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  33.16 
 
 
387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  33.9 
 
 
375 aa  196  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 
393 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 
400 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  31.51 
 
 
388 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  34.78 
 
 
400 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  34.95 
 
 
386 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  34.61 
 
 
400 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
410 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  31.33 
 
 
397 aa  192  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  32.16 
 
 
367 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  34.12 
 
 
385 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  32.69 
 
 
380 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  37.02 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  32.77 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 
386 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2961  aminotransferase class I and II  34.51 
 
 
400 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>