More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2410 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2410  aminotransferase class I and II  100 
 
 
370 aa  755    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  68.85 
 
 
371 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1506  aminotransferase, class I and II  66.76 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0911  aminotransferase, class I and II  56.46 
 
 
367 aa  431  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0994  aminotransferase  54.79 
 
 
369 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  52.6 
 
 
367 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  48.11 
 
 
370 aa  348  7e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3133  aminotransferase  48.11 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.475875 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  45.11 
 
 
375 aa  316  4e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  44.54 
 
 
375 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  43.99 
 
 
375 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  43.24 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  45.68 
 
 
373 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2538  aminotransferase class I and II  45.63 
 
 
373 aa  298  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.408129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  44.14 
 
 
373 aa  293  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2821  aminotransferase class I and II  43.77 
 
 
388 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128266  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  43.73 
 
 
373 aa  280  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 
388 aa  250  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  38.01 
 
 
377 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  40.11 
 
 
381 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  37.67 
 
 
396 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  39.62 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  39.62 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  36.53 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  38.19 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  38.21 
 
 
382 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  36.97 
 
 
390 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  38.06 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  36.27 
 
 
387 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  38.52 
 
 
379 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  36.83 
 
 
396 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0832  aspartate aminotransferase  37.8 
 
 
384 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0198108  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  37.57 
 
 
387 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  37.2 
 
 
387 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  35.65 
 
 
375 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  34.05 
 
 
380 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 
386 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  38.25 
 
 
380 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  34.05 
 
 
380 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  37.2 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  36.29 
 
 
396 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  36.68 
 
 
387 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1110  aminotransferase class I and II  38.2 
 
 
402 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  37.47 
 
 
387 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  36.2 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  36.66 
 
 
398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  35.26 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  36.49 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  36.72 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  36 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  36.68 
 
 
385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  36.41 
 
 
387 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  36.14 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  36.41 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
395 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  37.64 
 
 
391 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  36.15 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  36.15 
 
 
387 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  35.75 
 
 
396 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  35.26 
 
 
395 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  35.92 
 
 
380 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  34.75 
 
 
390 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1370  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 
378 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  34.03 
 
 
395 aa  229  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.72 
 
 
387 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  36.12 
 
 
398 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  35.88 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  35.88 
 
 
387 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1672  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 
400 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  35.54 
 
 
399 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  38.02 
 
 
388 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  34.2 
 
 
392 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  36.76 
 
 
376 aa  227  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1495  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
400 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.473774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  34.7 
 
 
380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  34.2 
 
 
392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1448  aspartate aminotransferase  38.96 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.7202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  34.97 
 
 
397 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  38.06 
 
 
393 aa  225  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0426  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 
374 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  35.42 
 
 
407 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  38.92 
 
 
383 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  34.7 
 
 
397 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  36.46 
 
 
386 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  36.14 
 
 
396 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>